摆脱片段分选设备依赖 | 一种简便的长读长靶向测序技术
- boke
- 2022-09-26
- 7:21 上午
基于杂交的靶向富集在NGS中已经被广泛使用，技术相对成熟。尽管第三代长读长测序方法在解决高度重复和基因组结构变异方面拥有巨大优势，但由于目前存在的复杂工作流程和设备依赖性，针对长片段的目标富集尚未实现同样的高通量。
因此，研究人员开发了一种可达7Kb片段长度的规模化靶向捕获流程，该流程可以达到 >65%的中靶率，足够的覆盖深度（142.7×）、优异的覆盖均一性以及低冗余度（16.5%）。此外，通过临床样本和基因组标品测试，该流程也展现了卓越的检测准确性。
图1 该研究中的长读长靶向检测流程示意图
在整体流程上，该方法通过磁珠片段化筛选代替了传统的分选方法（BluePippin™或SageELF™），从而克服了对片段分选设备的依赖性；与先前的8-plex不同，该技术在个性化接头和配套Blocker的加持下，杂交Pooling达到16-plex，成本进一步降低；值得一提的是，与1xTiling的探针设计不同，该技术的Panel采用0.5x Tiling，Panel成本也得到控制；因此，整个流程更加简化、通量更高，成本更低。
图2 不同长片段富集方法比较
伯科生物拥有靶向测序全流程国产化整体解决方案，已在长读长靶向测序应用领域积累了大量项目经验，可以提供从探针设计和合成、个性化接头/Blocker设计生产、其他标准捕获配套试剂以及相关技术的开发优化服务，生产周期短、性能优异。
