杂交清洗缓冲液配套试剂
产品介绍
杂交与清洗缓冲液的高质量是获得优异捕获数据的前提。平衡捕获的特异性和均一性，提升对低GC、高GC区域的覆盖度，是杂交与清洗缓冲液开发的关键。通过摸索基础缓冲液，添加多种小分子化合物，调整不同组分浓度，同时利用突变标准品对缓冲液进行检验，团队研发出与DNA探针相匹配的高性能杂交清洗缓冲液（Hybridization and Wash Kit, CAT#: TC0023）与快速杂交清洗缓冲液（Rapid Hybridization and Wash Kit V2, CAT#: TC0024）。
产品优势
- 搭配伯科设计生产的panel使用
- 优异的杂交和洗脱性能
缩短杂交时间，4小时高效完成捕获反应
基本参数
在特异性与均一性方面，伯科的TargetCap® Hybridization and Wash Kit（TC0023）与友商I同类产品不相伯仲。在均一性方面，比较每个区域深度与平均深度的比值，伯科与友商I相关性高，相关性系数R ≥0.980。
图1. Hybridization and Wash Kit与友商I的性能比较。通过对200ng
标准品NA12878的gDNA进行建库，对180Kb的Panel进行交杂，
杂交的预文库投入量为500ng，杂交时间4小时，比较伯科的
Hybridization and Wash Kit与友商I的差异，数据表现两者达到高度一致.
图2. Hybridization and Wash Kit与友商I的性能比较。通过对200ng
标准品NA12878的gDNA进行建库，对250Kb的Panel进行交杂，
杂交的预文库投入量为500ng，杂交时间4小时，比较伯科的
Hybridization and Wash Kit与友商I的差异，数据表现两者达到高度一致.
图3. 杂交洗脱试剂与友商I比较，两者达到极高的相关性。
变异检测
使用伯科TargetCap® Hybridization and Wash Kit试剂盒对含有不同突变类型的多种样本进行杂交捕获，经NGS测序分析。分析结果显示，不论是点突变、小片段缺失、扩增还是重排，伯科试剂盒均能获得与友商I一致的检测结果，同时，所获得的变异频率也具有极高的相关性。
伯科的TargetCap® Hybridization and Wash Kit与友商I的杂交清洗试剂盒在变异检测的相关性。分别取4例FFPE样品（起始量300ng/样），3例血浆样品（起始量20ng/样），1例白细胞样品（起始量300ng），与170Kb的Panel杂交，杂交文库投入量为500ng，杂交时间12~16小时，伯科的测序深度在800~4250x，友商I测序深度在1132~5635x。
图4. Hybridization and Wash Kit与友商I的杂交清洗试剂盒在变异
检测的相关性系数达到0.999。
变异检测
下表为与友商I的杂交清洗试剂盒在变异检测的比较差异
批次稳定性
伯科TargetCap® Hybridization and Wash Kit试剂盒的成品检验采用内部参考品文库进行NGS检测，保证试剂盒的性能和稳定性。使用不同批次生产的杂交与清洗试剂盒对内部参考品进行杂交捕获，经NGS测序分析。测序数据显示，不同批次试剂盒所获得的捕获效率和均一性相关性高，数据质量稳定。
图5. 不同批次的 Hybridization and Wash Kit在不同指标的性能比较。
图6. 不同批次的 Hybridization and Wash Kit在平均测序深度的相关性
快速杂交清洗缓冲液
为解决杂交实验周期长的问题，Rapid Hybridization and Wash Kit V2快速杂交洗脱液，能够将杂交时间从12~16小时，压缩至0.5小时，且相比常规杂交洗脱试 剂，有较大的性能提升。
快速杂交清洗缓冲液数据表现
通过友商I与伯科在常规杂交缓冲液、快速杂交缓冲液在不同杂交时间，得到捕获效率与均一性的数据比较结果如图3-23所示。实验以200ng的gDNA起始构建文库，取500ng的预文库，投入杂交捕获，与180Kb的Panel杂交。结果显示，在常规杂交清洗缓冲液条件下，不论4小时还是0.5小时，友商I与伯科在捕获效率、0.2倍平均深度、0.5倍平均深度数据表现相当，且伯科在均一性指标优于友商I。在0.5小时的快速杂交时间条件下，快杂缓冲液的均一性高于常规杂交缓冲液，两者在0.2倍平均深度相当，快杂缓冲液高于常规缓冲液约0.5%；在0.5倍平均深度，快杂缓冲液高于常规缓冲液2%左右。
图7. Rapid Hybridization and Wash Kit V2（TC0024）基本数据表现。
常规缓冲液在4小时杂交与常规缓冲液0.5小时杂交的关联系数为0.876；常规缓冲液4小时杂交与快杂缓冲液0.5小时杂交的关联系数在0.95左右，说明快杂缓冲液与常规杂交4小时的效果相当。
图8. 不同杂交时间、不同杂交缓冲液的相关性分析
联系伯科
电话：0510-68108516
邮箱： info@bokebiotech.com
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提供售后服务
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类别
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产品
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反应数
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货号
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体积
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存储温度
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说明
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杂交清洗缓冲液
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96 rxn TargetCap® Hybridization and Wash Kit
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96 rxn
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TC0023
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–
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–
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常规杂交清洗缓冲液
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96 rxn Rapid TargetCap® Hybridization and Wash Kit V2
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96 rxn
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TC0024
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–
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–
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快速杂交清洗缓冲液
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配套试剂组
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类别
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名称
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货号
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规格
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试剂说明
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组分说明
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组分货号
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|---|---|---|---|---|---|---|
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illumina Truseq文库捕获试剂
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TargetCap® Capture Kit Box 1 Illumina-TS
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TC00311
|
96 rxn
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探针溶解buffer
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Probes Dissolve Buffer
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TC0014
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Blocking Reagents（ILMN-TS Blockers&Cot1）
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Cot-1 DNA
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TC0016
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||||
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96 rxn Universal Blockers-ILMN-TS(Du)
|
TC0010D9
|
|||||
|
PCR Enrichment Reagents（ILMN）
|
2x PCR ReadyMix
|
TC0018
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||||
|
10x PCR PrimerMix(Illumina)
|
TC00191
|
|||||
|
Elution Buffer
|
TC0015
|
|||||
|
Hybridization and Wash Reagents
|
2x Hybridization Buffer
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TC0001
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||||
|
Hybridization Enhancer
|
TC0002
|
|||||
|
2x Beads Wash Buffer
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TC0003
|
|||||
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10x Wash Buffer S
|
TC0004
|
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|
10x Wash Buffer I
|
TC0005
|
|||||
|
10x Wash Buffer II
|
TC0006
|
|||||
|
10x Wash Buffer III
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TC0007
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|||||
|
illumina Nextera文库捕获试剂
|
TargetCap® Capture Kit Box 1 Illumina-NT
|
TC00312
|
96 rxn
|
探针溶解buffer
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Probes Dissolve Buffer
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TC0014
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Blocking Reagents（ILMN-NT Blockers&Cot1）
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Cot-1 DNA
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TC0016
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96 rxn Universal Blockers-ILMN-NT
|
TC00119
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|||||
|
PCR Enrichment Reagents（ILMN）
|
2x PCR ReadyMix
|
TC0018
|
||||
|
10x PCR PrimerMix(Illumina)
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TC00191
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|||||
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Elution Buffer
|
TC0015
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Hybridization and Wash Reagents
|
2x Hybridization Buffer
|
TC0001
|
||||
|
Hybridization Enhancer
|
TC0002
|
|||||
|
2x Beads Wash Buffer
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TC0003
|
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10x Wash Buffer S
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TC0004
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10x Wash Buffer I
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TC0005
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10x Wash Buffer II
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TC0006
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|||||
|
10x Wash Buffer III
|
TC0007
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|
MGI单端文库捕获试剂
|
TargetCap® Capture Kit Box 1 MGI-SI
|
TC00313
|
96 rxn
|
探针溶解buffer
|
Probes Dissolve Buffer
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TC0014
|
|
Blocking Reagents（MGI-SI Blockers&Cot1）
|
Cot-1 DNA
|
TC0016
|
||||
|
96 rxn Universal Blockers-MGI(SI)
|
TC0012S9
|
|||||
|
PCR Enrichment Kit（MGI-SI）
|
2x PCR ReadyMix
|
TC0018
|
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|
10x PCR PrimerMix(MGI-SI)
|
TC00192
|
|||||
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Elution Buffer
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TC0015
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|
Hybridization and Wash Reagents
|
2x Hybridization Buffer
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TC0001
|
||||
|
Hybridization Enhancer
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TC0002
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|
2x Beads Wash Buffer
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TC0003
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10x Wash Buffer S
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TC0004
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10x Wash Buffer I
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TC0005
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10x Wash Buffer II
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TC0006
|
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|
10x Wash Buffer III
|
TC0007
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|
MGI双端文库捕获试剂
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TargetCap® Capture Kit Box 1 MGI-Du
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TC00314
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96 rxn
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探针溶解buffer
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Probes Dissolve Buffer
|
TC0014
|
|
Blocking Reagents（MGI-Du Blockers&Cot1）
|
Cot-1 DNA
|
TC0016
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96 rxn Universal Blockers-MGI(Du)
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TC0012D9
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|
PCR Enrichment Kit（MGI-Du）
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2x PCR ReadyMix
|
TC0018
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|
10x PCR PrimerMix(MGI-Du)
|
TC00193
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Elution Buffer
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TC0015
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Hybridization and Wash Reagents
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2x Hybridization Buffer
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TC0001
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|
Hybridization Enhancer
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TC0002
|
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2x Beads Wash Buffer
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TC0003
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|
10x Wash Buffer S
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TC0004
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|
10x Wash Buffer I
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TC0005
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10x Wash Buffer II
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TC0006
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10x Wash Buffer III
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TC0007
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链霉亲和素磁珠与文库纯化磁珠
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TargetCap® Capture Kit Box 2 (M270 Streptavadin Beads&Purification Beads)
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TC00321
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96 rxn
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含有Capture磁珠和文库纯化磁珠**
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M270 Streptavadin Beads
|
TC0017C
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|
Purification Beads
|
TC0017P
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