全外显子 Panel
产品介绍
Target Cap® Core Exome Panel v3.0是自主研发的一款全外显子捕获Panel，V3.0版本针对肿瘤检测拥有更好的均一性，能够加速推进临床研究。该Panel由伯科独家“智能映射”算法设计完成，在达到最大化覆盖的同时提高中靶率。通过大规模高通量生产，可减少批次效应。Target Cap® Core Exome Panel v3.0覆盖了RefSeq、CCDS、ClinVar等基因数据库的19,524个基因，约跨越人类基因组34.1M区域。
产品优势
- 更全的覆盖，基于最新的数据库版本，覆盖34.1M的人类蛋白编码区域
- 更好的性能 ，高质量生产标准，均匀富集目标区域，高品质探针(QC)
- 更加灵活，支持多样本混合捕获，灵活加入感兴趣的区域，实验操作简单、快捷(快速杂交最快4小时)
产品参数
- 参考基因组：GRCh38/hg38
- 基因数：19,524
- 探针数量：~400,000
- 目标区域范围：34.1Mb
- 探针属性：ssDNA
- 探针长度：120nt
基本参数
伯科生物TargetCap® Core Exome Panel v3.0比对率、冗余度、中靶率、目标区域覆盖率、数据有效性具有高特异性和高均一性。
图1. v3.0芯片自测评数据。冗余度为25%；中靶率（按Bases计算）
约为70%，中靶率（Reads计算）约为92%；目标区域覆盖率为99.3%；
数据有效性为12X/Gb。
图2. 伯科v3.0芯片不同平台自测评数据。5个gDNA标准品混合过夜杂交，
测序7.5G原始数据。
竞品性能对比
与其他外显子组相比，TargetCap® Core Exome Panel v3.0具有更高的均一性和更高的中靶率，以及更低的冗余度，这意味着更少的数据浪费和最大程度的目标区域覆盖。
右下图为伯科v3.0与友商K** Hy**、X**比较。冗余度伯科v3.0与K** Hy**均低于10%，伯科略高；在中靶率方面，伯科v3.0与K** Hy**两者一致，均为80%左右；三款芯片的目标区域覆盖率较为接近，均显示出完整的目标区域覆盖能力；在数据有效性指标上，伯科与K** Hy**接近。均一性上，伯科与K** Hy**参数上都非常接近，0.5x Mean Depth伯科略低于友商K** Hy**；在Fold 80方面，伯科为1.50左右，略低于友商K** Hy**。