Genome Medicine |多组学整合分析鉴定到介导新型免疫基因和心血管风险之间的致动脉粥样硬化代谢物
- boke
- 2024-11-15
- 5:45 下午
背景
了解基因-代谢物关联对心脑血管风险评估具有转化价值。研究功能性基因变异可以加深我们对疾病发病机制以及靶向干预措施的开发和优化方面的理解。
方法
本研究对GCAT（基因组生命队列）4974名欧洲血统个体血浆中总共187种代谢物水平进行了分析。对遗传分析结果进行了荟萃分析，并结合了其他数据集，最终纳入了大约4万名欧洲人。将荟萃分析结果与来自58种组织和细胞类型的参考基因表达谱整合，以识别与代谢物水平相关的推测基因表达。该方法也应用于三个独立的大型欧洲研究（样本量达 70 万）中，以识别与心脑血管风险额外相关的基因表达。最后，进行了基于遗传信息的介导分析，以推断基因表达、代谢物水平和心脑血管风险之间关系的因果介导作用。
结果
总共44个基因座与124种代谢物相关。主要遗传变异包括11个非同义突变。53个精细定位的基因的推测表达与108种代谢物水平相关；其中6个基因的推测表达也与心脑血管结局相关，尤其是调控基因HCG27的新作用。此外，我们发现致动脉粥样硬化的代谢物水平在基因表达与心脑血管风险之间起到了中介作用。其中一些基因在免疫细胞丰富的组织中显示出更强的关联，进一步证明了免疫细胞在增加心脑血管风险中的作用。
结论
这些发现提出了新的基因靶点，这些靶点可能是药物开发的潜在候选者，旨在通过调节血液中致动脉粥样硬化代谢物水平来降低心血管疾病的风险。
参考资料
1.Carreras-Torres, R., Galván-Femenía, I., Farré, X. et al. Multiomic integration analysis identifies atherogenic metabolites mediating between novel immune genes and cardiovascular risk. Genome Med 16, 122 (2024).
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