Nature | 伯科技术平台助力番茄图泛基因组研究，为作物基因组育种提供高效、经济的育种芯片方案
- boke
- 2022-06-09
- 10:58 上午
2022年6月8日，Nature杂志在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文团队的两项关于作物基因组研究的重要成果，其中，番茄图泛基因组研究通过838个番茄基因组，包括32个全新的高质量基因组序列，构建了番茄图泛基因组集合。与传统参考基因组相比，图泛基因组遗传标记的遗传力大幅提升，这在很大程度上得益于图泛基因组包含了更多的结构变异（SVs）。新发现的SVs将通过标记辅助选择促进番茄的遗传改良基因组选择。本研究通过对番茄图泛基因组的全面解析，展示了图泛基因组在未来作物育种中的巨大能量。
伯科生物利用自身探针设计和合成方面积累大量数据和经验，利用“侧链补偿效应”首次完成了液相基因芯片在图泛基因组中结构变异检测中的应用(伯科生物参与设计SV panel of DNA capture array)。为未来分子农业，尤其是复杂性状育种提供了高效，经济可行的育种芯片方案。
SV DNA捕获芯片的探针设计原理Supplementary Fig. 20
伯科TargetCap®液相基因芯片技术是国内唯一100%全流程国产化基因捕获平台，适用于多物种、多组学以及不同测序平台（二代/三代测序）的基因靶向测序研究。未来，依托合成生物学的底层技术，伯科生物将向基因治疗、核酸药物、DNA存储、DNA材料学以及分子育种等领域积极拓展，为实现“精益求精创新，为人类美好生活”的企业使命而努力。
