近万例样本Target Cap®捕获技术表现
- boke
- 2022-05-05
- 9:00 下午
如图1所示，碱基质量Q30非常理想，保持在90%以上（平均值93.9%），Mapping、GC、Coverage等指标也表现稳定，Duplication和On-Target Ratio平均值分别为20.8%和57%，出现一定的波动与样本质量以及测序数据量有关，均一性参数0.2x Mean和0.5x Mean分别为99.7%和94.7%，CV均＜2.5%，表现优异且稳定。
图1. 5Mb Panel大规模捕获数据表现
接下来我们来看另一款Panel，其大小为0.65Mb，如图2所示，与5Mb Panel相比，各参数表现较为接近，Duplication略微上升，平均值为25.4%，与更高的测序深度有关，On-Target Ratio平均值55.5%；均一性上，0.2x Mean和0.5x Mean分别为99.7%和95.6%。
图2. 0.65Mb Panel大规模捕获数据表现
在真实世界中，样本纯度、完整度、建库方式、设备与耗材稳定性、实验操作等因素均会影响最终的捕获表现，也对捕获产品的性能提出了更高的要求。在Panel设计与合成中，伯科充分考虑了捕获挑战区域以及复杂序列的合成问题，从上述两款Panel近万例样本的捕获数据来看，伯科Target Cap®液相基因芯片技术完全能够胜任真实世界样本的挑战。综上，伯科Target Cap®技术应用于大规模样本捕获时表现稳定，用户高度认可。
全流程国产化是伯科建立之初的目标，目前，伯科已经完成所有捕获试剂的国产自主化，能够有效保证产品供应的稳定性和持续性。从Target Cap®液相基因芯片生产工艺建立以来，伯科已完成200+ Panel设计合成，超100万条探针合成，产品覆盖DNA、RNA、Methylation等不同组学以及不同测序平台的检测应用。
图3. 伯科Target Cap®液相基因芯片技术
